近卫辞去辅弼职务后，旋就任枢密院议长，并在平沼骐一郎内阁任无任所大臣。平沼内阁因为不测遭受苏德签订互不侵犯条约的局势，颠末7个多月就下台了，继任的阿部信行内阁也仅保持了5个月，然后是水兵大将米内光政组阁。1939年9月1日，希特勒闪击波兰，策动第二次天下大战，在随后不到一年时候里囊括全部西欧。德军的光辉战果极大地刺激了日本法西斯的侵犯野心。日本帝国王义者对侵华战役的对峙局面极其不满，急于扩大战役范围，他们激烈要求铁腕人物出马组阁，调剂日本的计谋。为此不吝搞垮了反对与德、意缔盟的米内内阁。
单单指责近卫大抵有些过于残暴。在容忍军部专断专行的背后存在着统帅权题目。据曾担负近卫内阁书记官长的风见章所写《近卫内阁》表露。
没有任何退路的百姓当局在1月19日百姓党《中心日报》上敏捷刊出蒋介石对日本近卫文麿声明的反应，说话激烈地表白了中国将持续抗日的态度:“中国当局于任何景象之下，必用尽力以保护中国主权与行政之完整。任何规复战役体例，如不以此原则为根本，绝非中国所能接管，同时，在日本占据地区内，如有任何不法构造篡窃政权者，非论对内对外，当然绝对无效。”
1938年5月占据徐州后，近卫对陆军的压力作出反弹，将倔强派带领人陆相杉山元和外相广田赶出内阁，起用对军部有影响力的板垣征四郎任陆相，宇垣一成任外相，荒木贞夫任文相。诡计规复对内阁的带领才气，但这三个也不是甚么和平分子。对于日军而言，战役的接连胜利进一步激起了军队对中国的鄙弃和对武力的狂热。早在日军占据南京后，日本大本营就开端研讨所谓“攻占汉口作战”。日军参谋本部谍报部对于攻占武汉的建议是:从汗青看，只要攻占武汉，就能安排中国，通过武汉会战，能够做到以武力处理中国事变大半的目标，只要节制了武汉，便能够把蒋政权逐出中原，“使蒋政权降为处所政权”。1938年3月31日，近卫内阁公布战时法律“国度总动员法”，动员天下人力物力为法西斯的团体战效力。1938年5月徐州会战一结束，日本方面即决定于当年春季停止“汉口作战”:统统在中国大陆作战的军队停止返国变更，海内持续动员增兵40万人，并拿出32.5亿日元的作战用度预算。
内阁为了干预统帅权曾想过各种百般的计划。如果能够实现的话，通过点窜宪法规定“建立掌管统帅权与国务的内阁轨制”是最好挑选，但“永不消逝的大典”--明治宪法是不成能有何窜改的。第二种计划是将除陆、海相以外的阁僚降格为各省长官，由辅弼指定几名在国表里有必然名誉的人来担负。但因为近卫对是否能找到有才气的人才没有信心，这个计划也被束之高阁了。第三种体例是设置有辅弼插手的大本营。因为陆军的反对做了一些让步，最后以设立大本营与内阁间的联络集会为名获得陆军承认。1937年11月20日，在宫中设置了大本营。在这个过程中近卫和其四周的人成心放风说近卫要辞职，陆军反而提出“现在近卫辞职不好办”。这也是他为获得对统帅权的干预权面使出的一个手腕。但是近卫以为“政战分歧”的设法有些分歧实际。
被迫辞职
新体制活动
下野与再次组阁
因兴亚院总裁宇垣遭到军部架空，玄月末俄然辞职，近卫想通过改组内阁节制军部的目标落空。近卫开端当真考虑总辞职题目。同年10月，日军占据广州、武汉后，中日战役转入相持阶段，日军的持久战好梦停业了。为此，近卫在11月3日颁发第二次对华声明，把对百姓党当局打击为主的战略改成政治诱降为主、军事打击为辅，以“共同防共”，“扶植东亚新次序”等标语向百姓党诱降。1938年12月，与蒋介石对峙的汪精卫逃到日本，12月22日，近卫又颁发第三次对华声明，提出闻名的“近卫三原则”，即“亲善友爱、共同防共、经济合作”。近卫以“局势进入新阶段”为由，于1939年1月4日提出总辞职。对于他的辞职既能够说是因为他被人嫌弃，也能够说是因为他本人感到带领才气已经到了极限，或者说是不负任务地不干了。被普通公众等候突破沉闷政治氛围的第一次近卫内阁没有完整燃烧就燃烧了，辞去辅弼的近卫和新任辅弼平沼骐一郎对调了位子，担负枢密院议长。