跟着1864年发作巴拉圭战役，巴西在战役中得以加快军需产业的生长。战役为巴西带来了贵重的作战经历，亦令巴西军队得以停止当代化。不过，巴西在这场战役中亦支出很大的性命代价，换来的是巴拉圭的国土。别的，战役亦加强了门路网的扶植及部分财产的生长，亦使得巴西开端走向当代化。当时欧洲的不稳局势为巴西带来欧洲的新移民，亦有助于巴西的生长。
但是，葡萄牙殖民者分开今后，巴西却要面对邻国阿根廷的影响。1825年10月，巴西南部的西斯普拉丁省（provinciacisplatina）宣布离开巴西并并入阿根廷，改称乌拉圭，巴西只得向阿根廷宣战。但是巴西未能获得任何冲破，而阿根廷海内呈现分离主义者的活动，两边只幸亏1827年中期签订草约，宣布乌拉圭仍为巴西国土。不久后，阿根廷再次对巴西用兵，翌年，巴西军被摈除，两边因而签订和约，承认乌拉圭为独立国度。
同年2月，葡萄牙驻巴西的军队开端打击巴西境内的分离活动。佩德罗因而撤消葡军批示官的职务，并向葡军下达后退的指令。一个月后，葡萄牙增救兵队达到里约热内卢外海。但被佩德罗回绝入港，达到里约热内卢声援的葡军及驻巴西葡军在补给后返回葡萄牙。但是，在伯南布哥省、巴伊亚省却开端呈现了流血事件，本地武装分子向驻军策动进犯，两边呈现流血抵触。5月，佩德罗宣布本身成为“巴西的庇护者”。
即便当局对各省的兵变加以弹压，但当局却有力进一步加强对各省的节制。为了挽回局势，在1840年间，帝国议会冷视摄政委员会的开会法律，再次召开议会，并咨询小佩德罗即位的志愿。厥后，小佩德罗同意即位，并于次年7月18日即位，规复天子的统治，以答复国度的同1、战役及繁华。
佩德罗二世即位后，立即拔除联邦轨制，再次建立中心集权的当局，加强对各省的节制。开初的几年间，共和主义者反对帝
1831年至1840年间，巴西帝国由三人摄政委员会理政，包含已返国的若泽・博尼法西奥・德・安德拉达。以帮手年幼的佩德罗二世。在这几年间，巴西境内开端呈现分歧的骚动及暴动，如1832年在东北部的帕拉伊巴省及伯南布哥省就呈现了请愿的海潮。厥后数年，海内的情势更加狼籍。1834年，安德拉达单独摄政。但没法节制各省的混乱事件，是以，国度放宽各省自治权，令中心当局的权威大幅减少。
但是，自废奴活动后，共和派人士也但愿能够打倒帝政，实现共和，令共和主义的呼声高涨。1887年，军官德奥多罗・达・丰塞卡构造军事俱乐部，开端策划政变。1889年11月15日，德奥多罗・达・丰塞卡与另一名军官弗洛里亚诺・阿劳霍・佩绍托结合共和派人士策动军事政变，胜利包抄内阁集会厅，掠取当局节制权。丰塞卡宣布拔除帝政，改行共和制，建立临时当局，而本来支撑帝政的农场主及地主却因为佩德罗二世支撑废奴轨制而背叛。两今后，佩德罗二世流亡至法国，巴西帝国正式崩溃。