其次的威胁来自蒲寿庚等大海商。俗话说“同业是仇敌”，轰隆军在流求生长必定挤占他们把持的海上贸易份额，而他们明显不会容忍流求公司从利润丰富的海上贸易分一杯羹。流求公司的蔗糖热卖已经让他们分外眼红，蒲寿庚等人现在也开端试着在福建路和广南路莳植甘蔗，今后为争夺发卖市场必定会产生抵触，乃至不解除他们用武力篡夺流求。这此海商气力强大，仅蒲寿庚就稀有万人马和数千艘船只，他还是朝廷任命的泉州市舶司长官员。这些还仅是蒲寿庚浮在大要的气力，实际上蒲寿庚等大海商不但与朝廷大佬好处绑定，也与海盗有千丝万缕的联络。
至于剩下的一百多万两白银资金，流求公司则全数投入水兵扶植。对孤悬外洋的流求岛来讲，扶植一支强大的水兵说成事关存亡存亡的关头并不为过。作为极度依靠设备的技术兵种，将水兵说成是吞金兽并不为过。海上风波大，所用的船只布局庞大，技术要求也高，代价天然也高贵。对流求公司来讲，所建的水兵船只必定要以火器设备为主。火器能力强大，但代价也天然不菲，就拿战船的主战设备火炮来讲，不但造价高贵，厥后续的保养保护和弹药耗损也是一笔庞大的开支。
水兵的主战兵器是船只，而船只的制作并非一朝一夕之事。一艘战船从选材、砍木、晾晒再到制作舾装、试航短则一年至两年，长则三至四年。如果有了已晾晒好的木料，也需求半年到一年的时候才气造出来。流求不管是当前的实际需求还是远期的威胁，都等不起这么长的时候，故余柱决定一方面派人收买造船木料，加大自行造船的力度，与此同时又派人多方重金采办船只停止改装，乃至还通过贿赂手腕采办了本地制置司水军的战船。“重赏之下必有勇夫”，只要代价给得充足高，水军那些官员敢冒着杀头的风险卖战船。这些买返来的战船在船厂停止改装以后，没有人会认出曾是官军战船。颠末一番尽力，流求采办改装了十余艘大中型船只和数十只小型船只，固然仍未达廖泥鳅的预期，却也处理了当下的燃眉之急。
几次核算以后，流求公司决定建立一支主力舰队和二支分舰队，别离驻守在台北、台南和小流求。主力舰队有十艘大型战舰、二十艘中型战舰和四十艘小型战舰，分舰队战船数量减半。按大型战舰一万五千两白银一艘，二十艘计三十万白银；中型战舰五千两一艘，六十艘计三十万白银；小型战舰二千两一艘，一百二十艘计二十四万白银，仅主力战船便要破钞八十四万两。如果再加上火战船、窥伺船、爆破船、运输船等船只，这一百多万两白银不但不算多，反倒显得略有不敷。在人数方面，每艘大型战舰一百五十人，中型战舰八十人，小型战舰三十人，总兵力达到了一万零二百人，如果加上帮助船只的海员人数，兵力达一万二千人。
高丽、倭国及北方汉军世侯的水军当下并无攻打流求的气力，但正因为这三地水军气力孱羸，其本地周边遍及着大大小小的海盗。这些海盗当中很多人是穷凶极恶的逃亡之徒，也有很多是迫于生存铤而走险的本地百姓，另有少数捕鱼经商为主，一有机遇便掳掠的海上讨糊口的机遇主义分子。这些海盗之前多数是贸易航路四周出没，并未呈现在流求周边。跟着轰隆军开辟奇迹的生长，流求日趋富强，这此海盗也如嗅到血腥的沙鱼一样，几次攻击流求公司的渔船和商船，乃至想偷袭台中城港口的蔗糖堆栈，只不过都无一例外埠火炮一顿胖揍。主管军务的廖泥鳅并不担忧这些散兵游勇，而是担忧他们背后影影绰绰的权势。