时弼攻陷京口，缘江诸戍望风尽走，弼分兵断曲阿之冲而入。丙寅，采石戍主徐子建至，告变。戊辰，乃下诏曰：”犬羊陵纵，侵窃郊畿，蜂虿有毒，宜时扫定。朕当亲御六师，廓清八表，表里并可戒严。”因而以萧摩诃为皇畿多数督，樊猛为上流多数督，樊毅为下贱多数督，司马消难、施文庆并为大监军，重立赏格，分兵镇守关键，僧尼羽士尽皆执役。庚午，贺若弼攻陷南徐州。辛未，韩擒虎又陷南豫州。隋军南北道并进。辛巳，贺若弼进军钟山，顿白土冈之东南，众军败绩。弼乘胜进军宫城，烧北掖门。是时，韩擒虎率众改过林至石子冈，镇东大将军任忠出降擒虎，仍引擒虎经朱雀航趣宫城，自南掖门入。城内文武百司皆遁出，唯尚书仆射袁宪、后阁舍人夏侯公韵侍侧。宪劝端坐殿上，正色以待之。后主曰：”锋刃之下，未可及当，吾自有计。”乃逃于井。二人苦谏不从，以身蔽井，后主与争久之方得入。沈后居处如常。太子深年十五，闭阁而坐，舍人孔伯鱼侍焉。戍士叩阁而入，深安坐劳之曰：”戎旅在途，不至劳也。”既而甲士窥井而呼之，后主不该。欲下石，乃闻叫声。以绳引之，惊其太重，及出，乃与张贵妃、孔朱紫三人同乘而上。隋文帝闻之大惊。开府鲍宏曰：”东井上于天文为秦，今王都地点投井，其天意邪？”先是江东谣多唱王献之《桃叶辞》，云：”桃叶复桃叶，度江不消楫，但度无所苦，我自接迎汝。”及晋王广军于六合镇，其山名桃叶，果乘陈船而度。丙戌，晋王广入据台城，送后主于东宫。
六月壬戌，大风，吹坏皋门中闼。
蒲月辛亥，高丽、新罗、丹丹、天竺、盘盘等国并遣使朝贡。
玄月丁巳，天东南有声如虫飞。
十仲春壬辰，司空章昭达薨。
夏蒲月戊子，以吏部尚书江总为尚书仆射。
闰六月丁卯，大雨，震大皇寺刹、寂静寺露盘、重阳阁东楼、千秋门内槐树及鸿胪府门。
二年春正月丁卯，分遣大使，巡省民风。癸巳，大赦。
三月乙丑，扶南、林邑国并遣使朝贡。
秋八月辛未，周人来聘。
玄月癸未，周临江太守刘显光率众来降。是夜，天东南有声，如风水相激，三夜乃止。
三月辛酉，前丰州刺史章大宝举兵反。
秋玄月癸未，尚书右仆射沈君理卒。壬辰晦，夜明。
十仲春癸卯，高丽国遣使朝贡。是岁，梁明帝殂。
十四年春正月己酉，上弗豫。甲寅，崩于宣福殿，时年五十三。遗诏：”凡厥终制，事从省约，金银之饰，不以入圹，明器皆用瓦。以日易月，及公除之制，悉还是准。在位百司，三日一临。四方州镇，五等诸侯，各守所职，并停奔赴。”仲春辛卯，群臣上谥曰孝宣天子，庙号高宗。癸巳，葬显宁陵。
六月戊戌，扶北国遣使朝贡。庚子，废皇太子胤为吴兴王，立扬州刺史始安王深为皇太子。辛丑，以太子詹事袁宪为尚书仆射。丁巳，大风自西北激涛水入石头城，淮渚暴溢，漂没舟乘。
冬十一月己亥，地动。
六月丁酉，周武帝崩。
夏四月庚戌，诏絓在军者，并赐爵二级。又诏御府堂署所营建，礼乐仪服军火以外，悉皆停歇。掖庭常供，贵爵妃主诸有奉恤者，并各量减。庚申，大雨雹。
夏蒲月庚寅，尚书左仆射王玚卒。
十二年夏四月癸亥，尚书左仆射陆缮卒。己卯，大雩。壬午，雨。
隋文帝谓仆射高颎曰：”我为百姓父母，岂可限一衣带水不拯之乎？”命高文战船。人请密之，隋文帝曰：”吾将显行天诛，何密之有！使投緌于江，若彼能改，吾又何求。”及纳梁萧瓛、萧岩，隋文愈忿，以晋王广为元帅，督八十总管致讨。乃送玺书，暴后主二十恶。又散写圣旨，书三十万纸，遍喻江外。